2016 release NIH onderzoekers identificeren opvallende genomische handtekening gedeeld door vijf vormen van kanker

2016 release NIH onderzoekers identificeren opvallende genomische handtekening gedeeld door vijf vormen van kanker

NIH onderzoekers identificeren opvallende genomische handtekening gedeeld door vijf vormen van kanker

"Het vinden van een onderscheidend-methylatie gebaseerde handtekening is als zoeken naar een spar boom in een dennenbos," zei Laura Elnitski, Ph.D. een computational bioloog in de afdeling Intramurale Onderzoek bij NIH&# 39; s National Human Genome Research Institute (NHGRI). "Het&# 39; s een technische uitdaging te identificeren, maar we vonden verhoogde methylatie handtekening rond het gen bekend als ZNF154 die uniek is voor tumoren." Dr. Elnitski is hoofd van de Genomic Functional Afdeling Analyse en senior onderzoeker bij de Translational en Functional Genomics Branch in NHGRI.

"Niemand in mijn fractie sliep de nacht na die ontdekking," Dr. Elnitski gezegd. "We waren zo opgewonden toen we vonden dit een kandidaat biomarker. Het&# 39; s de eerste in zijn soort te passen om zo veel vormen van kanker."

In deze nieuwe studie, ontwikkelden zij een reeks stappen die veelbetekenende methylatie merken colon-, long-, borst-, maag- en endometriale kankers ontdekt. Zij toonden aan dat alle tumortypen en subtypen consequent dezelfde methylatie merk rond ZNF154 geproduceerd.

"Het vinden van de handtekening methylering was een ongelooflijk zwaar en waardevol proces," zei NHGRI Wetenschappelijk Directeur Dan Kastner, M.D. Ph.D. "Deze bevindingen kunnen een belangrijke stap in de ontwikkeling van een test om vroege vormen van kanker te identificeren door middel van een bloedtest te zijn."

NIH Intramurale Sequencen Center sequentie de tumor DNA die was geamplificeerd met behulp van een techniek genaamd polymerase kettingreactie (PCR). Dr. Elnitski en haar groep vervolgens geanalyseerd de resultaten, het vinden van verhoogde niveaus van methylatie op ZNF154 over de verschillende soorten tumor.

Om de verbinding tussen de toegenomen methylering en kanker, Dr. Elnitski controleren&# 39; s ontwikkelde een computerprogramma dat in het DNA van mensen met en zonder kanker op de methylatie markeringen uitzag. Door het toevoeren van deze informatie in het programma, konden ze een drempelwaarde te voorspellen voor het detecteren van tumor DNA. Zelfs wanneer zij de hoeveelheid gemethyleerde moleculen verminderd met 99 procent, kan de computer nog detecteert de kankergerelateerde methylatie markeringen in het mengsel. Wetende dat tumoren vaak DNA afgestoten in de bloedbaan, zij berekende de verhouding van circulerend tumor DNA die kunnen worden gevonden in het bloed.

Dr. Elnitski volgend begint screening bloedmonsters van patiënten met blaas, borst, colon, pancreas en prostaat kanker om de nauwkeurigheid van de detectie bepalen in lage niveaus van circulerend DNA. Tumor-DNA in een persoon met kanker omvat typisch tussen 1 en 10 procent van alle DNA die in de bloedbaan. De groep merkte op dat bij 10 procent van de circulerende DNA de handtekening tumor bevat, hun detectie is heel goed. Omdat de methylering gedetecteerd kon worden bij zulke lage niveaus, zou het wenselijk is om gevorderde kanker en een aantal intermediaire en vroege tumoren te detecteren, afhankelijk van het type.

"Eierstokkanker is moeilijk te detecteren in een vroeg stadium, en er geen bewezen vroege detectiemethoden" zei Dr Annunziata. "We hebben een betrouwbare biomarker voor het detecteren van de ziekte wanneer genezing waarschijnlijker. We kijken ernaar uit om het testen van Dr. Elnitski&# 39; s nieuwe benadering met behulp van DNA-methylatie handtekeningen."

Huidige bloedonderzoeken specifiek voor een bekende tumortype. Met andere woorden, moet eerst vinden artsen de tumor verwijderen van een monster te bepalen en de genoomsequentie. Zodra de tumor-specifieke mutaties bekend zijn, kunnen ze worden bijgehouden voor verschijning in het bloed. Het potentieel van de nieuwe aanpak is dat geen voorkennis van kanker vereist, zou minder indringend dan andere screeningsmethoden zoals colonoscopies en mammogrammen en kunnen worden gebruikt om personen met een hoog risico kunnen worden gevolgd voor kanker of de activiteit van een tumor te controleren tijdens de behandeling. Zodra het bloedonderzoek wordt ontwikkeld, moet de wetenschappelijke studies uit te voeren om ervoor te zorgen dat het niet de aanwezigheid van kanker geeft wel aan als het er niet is of miss kanker toen het er is.

Dr. Elnitski heeft nog niet begrijpt het verband tussen tumoren en verhoogde DNA-methylatie. Het kan ontsporing van normale processen te vertegenwoordigen in de cel, of het kan iets te maken met het feit dat tumoren verbruiken veel energie en omzeilen de cellulaire processen die groei in toom te houden. Onderzoekers ook don&# 39; t weet precies wat het gen ZNF154 doet.

"We hebben de basis voor de ontwikkeling van een diagnostische test, die de hoop van het vangen van kanker eerder en drastisch verbeteren van de overlevingskansen van mensen met verschillende vormen van kanker heeft gelegd," Dr. Elnitski gezegd.

NHGRI is een van de 27 instituten en centra op het NIH, een agentschap van het ministerie van Volksgezondheid en Human Services. De NHGRI Afdeling Intramurale Research ontwikkelt en implementeert technologie te begrijpen, diagnosticeren en behandelen van genomics en genetische ziekten. Aanvullende informatie over NHGRI is te vinden op: http://www.genome.gov.

National Institutes of Health (NIH). NIH, de natie&# 39; s medisch onderzoek agentschap, omvat 27 instituten en centra en is een onderdeel van de US Department of Health and Human Services. NIH is de primaire federaal agentschap het uitvoeren en ondersteunen van fundamenteel, klinisch en translationeel medisch onderzoek, en onderzoekt de oorzaken, behandelingen en behandelingen voor zowel de gemeenschappelijke en zeldzame ziekten. Voor meer informatie over de NIH en haar programma’s, bezoek www.nih.gov.

jeannine Mjoseth

NHGRI Communications

(301) 402-0911

Ook u kunt bestellen hier.

Read more

Geef een reactie

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd. Verplichte velden zijn gemarkeerd met *

3 × vier =